1、水的凈化：醫(yī)藥工業(yè)工藝用水分為飲用水、軟化水、純水（即去離子水、蒸餾水）和注射用水。

制劑生產(chǎn)用水，從開(kāi)始應(yīng)用自來(lái)水，進(jìn)一步采用了純水（包括去離子水及蒸餾水）和注射用水，更重要的是還規(guī)定了滅菌鍋和滅菌產(chǎn)品的冷卻用水。通常工業(yè)用原水為自來(lái)水，它是用天然水在水廠經(jīng)過(guò)凝聚沉淀與加氯處理得到的，但用工業(yè)標(biāo)準(zhǔn)來(lái)衡量，其中仍然含有不少雜質(zhì)，主要包括溶解的無(wú)機(jī)物和有機(jī)物、微細(xì)顆粒、膠體和微生物等。

溶解的無(wú)機(jī)物是純水處理的主要對(duì)象之一：它們表現(xiàn)為等當(dāng)量的陽(yáng)、陰離子。陽(yáng)離子如Na+Ca++……等，陰離子如SO4、Cl、NO3……等。溶解的有機(jī)物，如油脂碳?xì)浠衔铩⒐I(yè)有機(jī)廢水、洗滌劑以及微生物的代謝產(chǎn)物等，其特點(diǎn)是不帶電，但極微細(xì)。

微細(xì)顆粒包括各種懸浮或沉淀的固體粒子，它們不僅在原水中數(shù)量眾多，而且水的處理設(shè)備以及分配系統(tǒng)等各個(gè)部位都不斷產(chǎn)生脫落物。膠體物包括溶膠類(lèi)，例如硅酸、鐵、鋁的某些化合物，也包括一些高分子化合物如腐植質(zhì)膠體等。它們的粒徑比微細(xì)顆粒要小得多。微生物包括細(xì)菌、浮游生物及藻類(lèi)。其中特別是細(xì)菌，為純水制備中難以對(duì)付的一個(gè)方面，包括病毒與熱原在內(nèi)，粒徑屬于μm級(jí)及Nm級(jí)。并且條件適當(dāng)時(shí)它們就會(huì)在離子交換樹(shù)脂、活性碳、貯水罐以及各種閥門(mén)與管道中高速繁殖。細(xì)菌本身具有粒子的一切特性，菌體上并且往往含有金屬離子，又同時(shí)是有機(jī)物，需要采取綜合措施處理。“純水”或“超純水”的具體指標(biāo)是要根據(jù)不同使用目的來(lái)確定的，用于醫(yī)藥工業(yè)時(shí)主要指標(biāo)是電阻率和細(xì)菌、熱原；工業(yè)用水的“純度”是相對(duì)而言的，通常除軟化水外，多把脫鹽水、純水和高純水籠統(tǒng)稱(chēng)之為純水。在醫(yī)藥工業(yè)上，純水還包括蒸餾水，其電阻率（25℃）在0.1~1.0′106~1.0′107Ω/cm之間，剩余含鹽量在1~5mg/L~0.1mg/L以下，有一個(gè)相當(dāng)寬的區(qū)間。實(shí)際上的理想的“純水”是沒(méi)有的，因?yàn)樗哂袠O高的溶解性和不穩(wěn)定性，極易受其它物質(zhì)的污染而降低純度。

飲用水須用自來(lái)水或水質(zhì)較好的井水為水源，去離子水必須用飲用水為水源，經(jīng)離子交換而制備，蒸餾水可用飲用水經(jīng)蒸餾而制備，純水仍不能去除熱原，所以注射用水必須用上述方法制得的純水再進(jìn)一步通過(guò)蒸餾而制備。

純水制備是以原水為原料，經(jīng)逐級(jí)提純水質(zhì)使之符合生產(chǎn)要求。純水制備系統(tǒng)沒(méi)有一種固定模式，要綜合權(quán)衡多種因素根據(jù)各種純化手段的特點(diǎn)靈活組合應(yīng)用。既要受原水性質(zhì)、用水標(biāo)準(zhǔn)與用水量的制約，又要考慮制水效率的高低、能耗的大小、設(shè)備的繁簡(jiǎn)、管理維護(hù)的難易和產(chǎn)品的成本。

為了保證純水水質(zhì)穩(wěn)定，制成后應(yīng)在系統(tǒng)內(nèi)不斷循環(huán)流動(dòng)，以達(dá)到“流水不腐”的目的，即使暫時(shí)不用也仍要返回貯槽重新純化和凈化，再進(jìn)行循環(huán)，不得停滯。凈化水制備及管道制備凈化水和輸送凈化水的管道及安裝必須采用符合衛(wèi)生學(xué)要求的材料和安裝措施。

2、氣體的凈化：藥品生產(chǎn)企業(yè)所用的工業(yè)氣體主要指壓縮空氣和作為保護(hù)性氣體用的氮?dú)?。與藥物接觸的壓縮空氣以及洗瓶、分裝、過(guò)濾用的壓縮氣應(yīng)經(jīng)除油、除水等凈化處理。